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支付宝付款有时有短信提醒有时没有提示的原因可能有以下几种。
1、设置了短信通知服务但未生效或短信通知服务已过期，在支付宝付款时，系统会发送短信通知到绑定的手机号上，如果短信通知服务设置未生效或已过期，则无法收到短信提醒，此时可以重新开通或续费短信通知服务。
2、系统存在不稳定因素，有时系统繁忙或出现故障可能导致短信无法及时发送，这种情况下可能会暂时失去短信提醒功能，可以稍后再试或联系支付宝客服咨询。
3、付款金额较小，在某些情况下，如付款金额较小（如使用余额宝或银行卡余额进行小额支付），可能会选择不发送短信通知以节省成本。
4、手机网络问题或手机信号不稳定，如果手机网络不佳或信号不稳定，可能会导致短信无法及时接收，可以检查手机信号和网络连接是否正常，并尝试重新进入支付宝查看是否收到短信通知。
原因仅供参考，具体原因可能因个人设置、账户状态、付款金额等因素而有所不同，如果经常无法收到短信提醒，建议联系支付宝客服咨询具体原因并寻求解决方案。